Theo đó, nội dung đơn khởi kiện nêu, ngày 09/9/2016, Cục trưởng Cục Thuế TP. Hồ Chí Minh ký quyết định thanh tra thuế tại Công ty Cổ phần may Minh Hoàng (Công ty Hoàng Minh).

Ngày 25/5/2017, cơ quan này ký kết luận thanh tra và ban hành quyết định xử phạt hành chính đối với doanh nghiệp số tiền là hơn 9,3 tỷ đồng về hành vi vi phạm thủ tục về thuế, khai sai dẫn đến thiếu số tiền thuế phải nộp. Ngoài ra, Cục Thuế TP. Hồ Chí Minh còn ấn định số thuế mà Công ty Minh Hoàng phải nộp là hơn 689 triệu năm 2013 và hơn 671 triệu năm 2014.

Cho rằng những quyết định của Cục thuế TP. Hồ Chí Minh gây ảnh hưởng và thiệt hại cho doanh nghiệp, Công ty Minh Hoàng đã khởi kiện đơn vị này ra Tòa yêu cầu bồi thường thiệt hại - Ảnh minh họa

Cho rằng những quyết định của Cục thuế TP. Hồ Chí Minh gây ảnh hưởng và thiệt hại cho doanh nghiệp, Công ty Minh Hoàng đã khởi kiện đơn vị này ra Tòa yêu cầu bồi thường thiệt hại - Ảnh minh họa

Bên cạnh đó, thu hồi thuế GTGT của 7 kỳ hoàn thuế hai năm 2013 và 2014 với số tiền gần 40 tỷ đồng, tính tiền chậm nộp thuế GTGT bị thu hồi hơn 15 tỷ đồng, điều chỉnh giảm lỗ hơn 4,4 tỷ.

Không đồng tình với các quyết định của Cục thuế TP. Hồ Chí Minh, Công ty Minh Hoàng gửi Đơn khiếu nại lần một đến đơn vị này.

Một tháng sau, Cục trưởng Cục Thuế TP. Hồ Chí Minh ký quyết định cưỡng chế thi hành quyết định hành chính thuế bằng biện pháp trích tiền từ tài khoản của doanh nghiệp này tại ngân hàng. Đồng thời, không công nhận nội dung đơn khiếu nại của Công ty Minh Hoàng, doanh nghiệp tiếp tục gửi đơn khiếu nại tới Tổng cục Thuế - Bộ Tài chính.

Tháng 10/2018, Cục trưởng Cục Thuế TP. Hồ Chí Minh ký quyết định cưỡng chế bằng biện pháp thông báo hóa đơn của doanh nghiệp không còn giá trị sử dụng, sau đó, tiếp tục ban hành công văn thu hồi giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh, giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp, giấy phép thành lập và hoạt động, giấy phép hành nghề của Công ty Minh Hoàng.

Ngày 25/6/2019, Tổng cục trưởng Tổng Cục Thuế - Bộ Tài Chính giải quyết khiếu nại của Công ty Minh Hoàng, trong đó, đề nghị không thu hồi thuế GTGT 7 kỳ hoàn thuế hai năm 2013, 2014 với số tiền hơn 39,7 tỷ đồng của doanh nghiệp này, giao Cục Thuế TP. Hồ Chí Minh thực hiện kiểm tra, rà soát 5/7 kỳ hoàn thuế còn lại chưa được kiểm tra sau hoàn và xác định lại thuế của công ty này trong năm 2013 - 2014.

Trước các yêu cầu của Tổng Cục Thuế, Cục Thuế TP. Hồ Chí Minh đã ban hành các văn bản chấm dứt những văn bản đã ban hành trước đó và giải tỏa việc thu hồi giấy phép kinh doanh của Công ty Minh Hoàng.

Cho rằng việc thanh tra kéo dài kèm theo những quyết định bất hợp lý đã gây ảnh hưởng và thiệt hại nặng nề cho doanh nghiệp, Công ty Minh Hoàng đã khởi kiện Cục Thuế TP. Hồ Chí Minh, yêu cầu bồi thường hơn 68 tỷ đồng.