Cùng với việc đảm bảo tính khả thi, góp ý hoàn thiện chính sách về quản lý thuế, nhiều ý kiến cũng đề nghị, các quy định được đề xuất cần hướng tới giảm chi phí tuân thủ cho doanh nghiệp.
Như đã thông tin, Bộ Tài chính đã xây dựng và hoàn thiện Dự thảo Nghị định hướng dẫn Luật Quản lý thuế đưa ra lấy ý kiến với tinh thần xuyên suốt, lấy người nộp thuế làm trung tâm, đơn giản hóa quy trình, nâng cao tính minh bạch và khả thi của chính sách.

Song song với yêu cầu hoàn thiện quy định để đảm bảo tính khả thi, vấn đề giảm chi phí tuân thủ được các doanh nghiệp đặc biệt quan tâm, nhất là trong bối cảnh chuyển đổi số và gia tăng nghĩa vụ liên quan đến hóa đơn điện tử, thương mại điện tử.
Tham gia góp ý xây dựng và hoàn thiện chính sách, các chuyên gia cũng cho rằng, việc mở rộng nghĩa vụ khấu trừ và nộp thuế thay trên nền tảng số cần được thiết kế hợp lý để tránh chồng chéo. Nếu không phân loại rõ các loại thu nhập như bán hàng, quảng cáo, nội dung số hay tiếp thị liên kết, sẽ dễ dẫn đến việc áp dụng sai nghĩa vụ thuế, làm tăng chi phí tuân thủ cho cả doanh nghiệp và cơ quan quản lý.
Ngoài ra, quy định về hóa đơn điện tử khởi tạo từ máy tính tiền cũng được đánh giá là phù hợp với xu thế quản lý hiện đại, song cần có lộ trình và hỗ trợ kỹ thuật cụ thể. Bởi, nhiều doanh nghiệp phản ánh chi phí đầu tư thiết bị, yêu cầu tích hợp hệ thống và xử lý giao dịch sau bán hàng vẫn là thách thức lớn nếu không có hướng dẫn chi tiết.
Cùng với đó, việc tra cứu và chia sẻ dữ liệu hóa đơn điện tử giữa các cơ quan cần nâng cao tính liên thông dữ liệu, tránh tình trạng đã có thông tin trên hệ thống nhưng vẫn phải cung cấp lại hồ sơ, gây tốn kém thời gian và chi phí.

Theo đại diện Công ty Luật TNHH Quốc tế BMVN, đề xuất quy định sàn thương mại điện tử phải lập hóa đơn thay cho người bán là hộ, cá nhân kinh doanh nếu người mua yêu cầu có thể tạo ra gánh nặng đáng kể cho doanh nghiệp.
Vị đại diện này cho rằng, nghĩa vụ xuất hóa đơn vốn thuộc về người bán theo Luật Quản lý thuế, việc chuyển sang cho bên thứ ba thực hiện là chưa có cơ sở pháp lý rõ ràng.
“Quy định này không chỉ phát sinh thêm thủ tục hành chính mà còn kéo theo chi phí vận hành hệ thống, nhân sự và rủi ro sai sót trong quá trình thực hiện”, vị đại diện này nhấn mạnh.
Đồng thời bày tỏ, với khoảng 166 triệu đơn hàng mỗi tháng trên các sàn thương mại điện tử, nếu chỉ 10-15% người mua yêu cầu hóa đơn, số lượng hóa đơn phát sinh thêm có thể lên tới hơn 800.000 hóa đơn mỗi ngày.
Từ đó, đại diện Công ty Luật TNHH Quốc tế BMVN kiến nghị cơ quan soạn thảo cần cân nhắc kỹ lưỡng tác động của chính sách, đồng thời lấy ý kiến đầy đủ từ các đối tượng chịu ảnh hưởng trực tiếp trước khi ban hành quy định. Thay vì áp đặt nghĩa vụ, có thể thiết kế cơ chế phối hợp cung cấp thông tin để người bán chủ động thực hiện việc xuất hóa đơn.
Cùng với các vấn đề đã nêu, tham gia góp ý, ông Nguyễn Đức Thuận, Chủ tịch Hội các nhà quản trị doanh nghiệp Việt Nam cũng cho hay, Dự thảo chưa có quy định về vấn đề liên quan đến khai thuế thu nhập doanh nghiệp đối với doanh nghiệp nước ngoài có cơ sở thường trú tại Việt Nam phát sinh thu nhập liên quan đến cơ sở thường trú đó.
Trong khi, loại hình “cơ sở thường trú” là khái niệm rất quan trọng trong thông lệ quốc tế, được thừa nhận rộng rãi trong các hiệp định tránh đánh thuế hai lần. Khi doanh nghiệp nước ngoài có hoạt động tại Việt Nam thông qua cơ sở thường trú, phần thu nhập phân bổ cho cơ sở thường trú sẽ thuộc quyền thu thuế của Việt Nam. Tuy nhiên, Thông tư 20/2025/TT-BTC quy định chi tiết một số điều của Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp không quy định rõ phương pháp tính thuế cho nhóm đối tượng này, tạo nên sự không rõ ràng về cơ chế pháp lý, dẫn đến rủi ro khi xác định nghĩa vụ thuế cho cả người nộp thuế và cơ quan thuế.
“Chúng tôi kiến nghị Bộ Tài chính cân nhắc trình Chính Phủ tiếp tục áp dụng các quy định về thuế nhà thầu đối với các đối tượng này, cụ thể là bổ sung quy định hướng dẫn khai, nộp thuế khấu trừ tại nguồn theo phương pháp trực tiếp thông qua bên Việt Nam. Trong thời gian chưa có hướng dẫn, đề nghị Bộ Tài chính cho phép doanh nghiệp tiếp tục kê khai nộp thuế theo cơ chế thuế nhà thầu để đảm bảo tính liên tục và tránh việc thất thu thuế cho nhà nước cũng như rủi ro không tuân thủ cho doanh nghiệp”, ông Thuận chia sẻ.
Bên cạnh đó, góp ý cho Dự thảo Nghị định quy định về hóa đơn điện tử, chứng từ điện tử, ông Thuận bày tỏ, hiện quy định hiện hành không có hướng dẫn về việc xuất hóa đơn đối với trường hợp xuất hàng hóa bảo hành, thay thế cho hàng hóa đã xuất bán trước đó nhưng bị lỗi hỏng và người bán đã xuất hóa đơn cho người mua dẫn đến doanh nghiệp gặp khó khăn, lúng túng không rõ có phải hủy hóa đơn cũ, xuất hóa đơn mới khi xuất hàng bảo hành hay không. Thực tế cũng có thể có nhiều diễn giải khác nhau dẫn đến việc thực hiện không thống nhất.
“Dự thảo nên có quy định việc xuất hàng bảo hành như trên thuộc trường hợp không phải xuất hóa đơn điện tử, do thực tế giao dịch bán hàng, ghi nhận doanh thu bán hàng đã phát sinh từ trước đó. Việc xuất hàng bảo hành chỉ là xuất bù hàng đã bán do hàng bị lỗi hỏng”, ông Thuận đề xuất.