Yêu cầu truy thu tiền thuê đất thiếu căn cứ, Cục Thuế “thua” doanh nghiệp

Theo Tòa án Nhân dân (TAND) TP. Cần Thơ, đơn vị vừa xử sơ thẩm vụ kiện hành chính giữa Công ty CP Vật liệu xây dựng Motilen Cần Thơ (Công ty Motilen) và Cục trưởng Cục Thuế TP. Cần Thơ, liên quan đến việc Cục trưởng Cục Thuế đã ra hai quyết định cùng hai thông báo yêu cầu doanh nghiệp phải truy thu hơn 800 triệu tiền thuê đất.

Cho rằng, Thông báo số 2536 năm 2009; Thông báo số 12591 năm 2019; Quyết định số 3158 năm 2019 và Quyết định số 406 năm 2020 của Cục trưởng Cục Thuế TP. Cần Thơ, vi phạm nghiêm trọng pháp luật, làm ảnh hưởng lớn đến quyền, lợi ích hợp pháp của mình, Công ty Motilen khởi kiện yêu cầu Tòa án hủy các quyết định và thông báo nêu trên.

Công ty Motilen cho rằng, mình Công ty cổ phần hóa từ Công ty Sản xuất kinh doanh vật liệu xây dựng số 2 (Công ty số 2), được thành lập từ ngày 11/4/2007, việc chuyển đổi này đã được chủ tịch UBND TP. Cần Thơ phê duyệt vào năm 2006.

Trong biên bản của Sở Tài chính, thời điểm cổ phần hóa không nói đến khoản tiền thuê đất nào phải nộp như Thông báo số 2536 năm 2009 của Cục Thuế TP. Cần Thơ với số tiền hơn 350 triệu đồng.

Sau khi có tư cách pháp nhân, tháng 8/2007, Công ty Motilen ký hợp đồng thuê thửa đất hơn 8.000 m2 tại số 241 đường 30/4 của UBND TP. Cần Thơ, giá thuê hơn 711 triệu đồng/năm. Sau đó, công ty ký hợp đồng thuê đất khác thay thế hợp đồng ban đầu, và cho rằng mình chỉ phải nộp tiền thuê đất cho Nhà nước kể từ ngày 01/01/2007 chứ không phải năm 2006.

Tại phiên Tòa, HĐXX cho rằng Cục Thuế ban hành Thông báo số 2536 là đơn phương nâng giá tiền thuê đất năm 2006, bởi trong giai đoạn từ năm 1999 đến ngày 31/12/2006, việc thuê đất của Công ty số 2 được quy định tại Hợp đồng thuê đất từ năm 2000, hợp đồng này quy định giá thuê đất là hơn 72 triệu đồng/năm và nếu cơ quan Nhà nước có thẩm quyền cho phép thay đổi mục đích sử dụng, diện tích sử dụng, giá thuê đất thì các bên phải làm lại hợp đồng.

Cũng tại phiên xét xử, Cục Thuế (bị đơn) và người có nghĩa vụ và quyền lợi liên quan (UBND TP. Cần Thơ) đã thừa nhận, trong năm 2006, giữa UBND TP và Công ty số 2 không làm lại hợp đồng thay đổi giá thuê đất, đến năm 2007, UBND TP ban hành quyết định thu hồi đất thuê không còn sử dụng của Công ty số 2, sau đó các bên đã thanh lý Hợp đồng đã ký năm 2000.

Khi Công ty số 2 cổ phần hóa thành Công ty Motilen, có thay đổi diện tích thuê đất và ký với UBND TP. Cần Thơ hợp đồng thuê đất mới với giá thuê là hơn 700 triệu đồng. Do đó, theo HĐXX, giá thuê đất trong năm 2006 phải được tính theo Hợp đồng năm 2000 là hơn 72 triệu đồng/năm.

Đồng thời, bị đơn cũng thừa nhận Công ty số 2 đã nộp đủ tiền thuê đất vào năm 2006 theo giá thuê của hợp đồng nên không có cơ sở buộc Công ty Motilen nộp thêm tiền thuê đất của năm 2006.

Mặt khác, thông báo truy thu tiền thuê đất năm 2006 nhưng lại vận dụng giá thuê đất theo hợp đồng ký vào năm 2007 mà không xem xét đến thỏa thuận trong hợp đồng thuê đất là không phù hợp.

Từ đó, tòa cho rằng việc bị đơn ban hành các thông báo, quyết đinh để truy thu tiền thuê đất là không đủ cơ sở, không có căn cứ, yêu cầu khởi kiện của Công ty Motilen là có căn cứ nên chấp nhận hủy toàn bộ cả hai quyết định và hai thông báo của Cục Thuế TP. Cần Thơ.